ECHO-Viren verursachen überwiegend asymptomatische Infektionen (90 bis 95 %), wobei neutralisierende Antikörper gebildet werden. Die mittlere Inkubationszeit beträgt 7 bis 14 Tage. Das Virus vermehrt sich im Intestinaltrakt und kann anschließend über die abführenden Lymphbahnen in den Blutkreislauf gelangen und zu einer zyklischen Infektion mit Ausbreitung auf die Zielorgane führen. ECHO-Viren zeigen ein breites Krankheitsspektrum und können folgende Organe befallen: Verdauungstrakt, Meningen, ZNS, Myokard, Perikard, quergestreifte Muskulatur, Respirationstrakt und Haut. Die meisten ECHO-Viren sind mit Infektionen des ZNS assoziiert, von denen die aseptische Meningitis im Vordergrund steht.